定時総会
函館馬主協会の最高決定機関
前年度決算・本年度予算等を審議承認
理事会
協会運営のため定期的に開催し、総会で決定した事業計画・予算に従い種々の事業を執行する。
三役会
各委員会より立案された事業の検討を行う。
総務委員会
協会の財務・庶務・諸規定・慶弔等に関する事項を扱う。
函館競馬場で施行される特別競走・重賞競走の優勝馬主さんへ贈る賞品の選定を扱う。
事業サービス委員会
会員懇親会・会員研修会・愛馬会等に関する事項を扱う。
広報委員会
会報ならびに広報全般に関する事項を扱う。
馬場委員会
函館競馬開催前の馬場に関する事項等を扱う。
社会貢献委員会
馬主社会福祉財団の助成金や社会貢献に関する事項等を扱う。
